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答案是肯定的。

首先，真核生物的染色体我们都很熟悉，基因组DNA上，由于磷酸骨架带负电，会结合带正电的蛋白形成较稳定的结构，以保持基因组DNA的稳定，并且为长链DNA的压缩折叠提供条件。

真核生物染色质结构

如上图，DNA贡献了染色质1/3的质量，而DNA结合蛋白贡献了2/3的质量。DNA结合蛋白中，组蛋白（histone）的比例和各种形式的非组蛋白（non-histone）之和近似，各占1/3.

核小体的组装

真核生物DNA双螺旋以螺线管方式围绕组蛋白核心，以左旋方式进行缠绕。核小体的包装对于负超螺旋的引入至关重要。负超螺旋有利于快速解旋，这对于基因表达的调控也很重要。

那么原核生物呢？我们知道，原核生物的基因组不会像真核生物那样形成染色体，也没有细胞核，原核生物的DNA是裸露状态吗？

典型的原核生物基因组仅有一个染色质拷贝，包装在一个叫做类核的结构中。当原核细胞快速分裂时，复制过程中的那部分染色体有时会存在2个或者4个拷贝。尽管真核生物，细菌和古细菌的细胞组织存在差异，它们都依靠DNA来存储和复制遗传信息。

单倍体细菌

在细菌和古细菌中也都发现了改变DNA形状的蛋白质。这些蛋白与DNA结合，使其更加紧凑，并且可能影响转录。

真核生物中的这些蛋白质被称为组蛋白和非组蛋白，我们已经清楚的知道很多它们影响染色质结构和转录的实例。最初，这种在细菌和古细菌中完成相似任务的蛋白质称为“组蛋白样”蛋白质（histone-like proteins）。然而，等到揭示了这些细菌蛋白质的独特性质，更精确地反映它们的功能之后，该术语变得不太合适。这些蛋白与组蛋白之间并没有任何结构上的相似性，它们现在统称为类核蛋白相关蛋白（nucleoid-associated proteins，NAPs）。

细菌细胞中，基因组DNA与各种类核蛋白相关蛋白（NAPs）形成聚集结构。各种类核蛋白相关蛋白具有不同的结构和功能，参与原核生物基因组DNA的复制，分离，翻译和修复。

真核生物，古细菌和细菌的类核蛋白相关蛋白

类核蛋白相关蛋白和DNA超螺旋影响染色质结构

组蛋白样核蛋白结构蛋白（H-NS）与DNA结合并影响其结构

大肠杆菌及其近亲也为我们理解染色质在类核中的储存提供范例。染色质存在于拥挤的空间中，在这个空间中，熵可以影响DNA的运动和稳定性。 DNA形成直径约10μm的随机卷曲DNA的云，将染色质细分成大约400个独立的约10kb的环提供了进一步的压实，并且环的负超螺旋进一步减小了折叠染色质的直径。类核蛋白相关蛋白和其他DNA结合蛋白可以约束超螺旋，改变染色体中有效DNA超螺旋的水平。这将大肠杆菌中DNA的超螺旋密度从裸DNA的-0.05降低至蛋白结合分子的-0.025。这是相当重要的，因为在许多情况下，转录启动子活性对超螺旋的局部有效水平是敏感的，启动子的活性可响应于超螺旋变异而增加或减少。

参考文献：

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